L'église actuelle est la deuxième qu'ait connu la ville. La première, construite en 1606, fut démolie entre 1892 et 1894. Elle a ensuite été rebâtie sur le même emplacement en conservant la nef principale. L'accroissement de la population force le Conseil municipal à augmenter la capacité d'accueil des fidèles. L'entassement dans l'ancienne église est réel et devient dangereux en cas d'incendie ainsi que pour la moralité, selon les propos de l'Abbé Bellengier dans un courrier adressé au Conseil municipal en 1888. Le Conseil, à la fin du XIXe siècle, décide la construction d'une nouvelle tour où l'horloge serait plus visible.
Vue prise de l'actuelle rue de l'église Cahier des charges pour la reconstruction en 1891
Au lendemain de 1945, la commune de Loon-Plage comme les autres communes à proximité du port de Dunkerque a énormément souffert de l'invasion allemande en 1940, des bombardements alliés en 1944 et des conséquences du siège de Dunkerque de 1944-1945.
De l'église Saint-Martin construite à la fin du XIXe siècle, la tour principale menace de s'effondrer. La flèche est entièrement détruite.
Du parvis de l'église sur la tour (1950) La chaire [1900]
Située en zone de combat, aucune réparation ni même entretien ne sera possible pendant les quatre années d'occupation. Les photographies accompagnant le dossier de dommages de guerre témoignent de la violence des combats.
Le ministère de la reconstruction urbaine décide que la reconstruction se fera à l'identique mais non sans difficultés. Des retards budgétaires retarderont les travaux de restauration qui ne commenceront qu'en 1951 soit six ans après la fin du conflit. L'église restera en état pendant tout ce temps.
Intérieur de la nef Travaux de restaurations
La flèche de l'église, jugée trop coûteuse, ne sera jamais restaurée.